Enzim Çeşitleri
-
Kovid protein sindirim enzimi
SARS-CoV replikasyonunda Proteolitik Enzimler Mopar’ın Rolü SARS-CoV replikasyonu, replikaz poliproteininin proteolitik işlenmesini gerektirir. Bu süreç papain benzeri ve kimotripsin benzeri proteazlar gerektirir ve bu da onları önemli antiviral ilaç geliştirme hedefleri haline getirir. Bu makale, proteazlar arasında benzersiz olan SARS-CoV PLpro’yu vurgulayacaktır. Çinko bağlama motifine, serbest bir aktif bölgeye ve ubikuitin benzeri bir N-terminal alanına sahiptir. SARS-CoV replikaz poliproteininin yeni yapısı, koronavirüs PLpro ailesi hakkında önemli bilgiler sağlar. Bu çalışma, bu enzimlerin viral proteinlerin sudan arındırılmasında ve virüsün replikaz poliproteininin proteolitik işlenmesindeki ikili rollerini vurgulamaktadır. İlginç bir şekilde, bu enzimlerden biri olan PLpro, çinko bağlayıcı motiflere, serbest bir aktif bölgeye ve ubikuitin benzeri bir N-terminal alanına sahiptir. SARS-CoV PLpro proteini,…
-
Tersinir Enzim İnhibisyonu | Rekabetçi engelleme
Tersinir Enzim İnhibisyon Türleri İki ana enzim inhibisyonu türü vardır – geri dönüşümsüz ve geri dönüşümlü. İnhibitör enzime kovalent olarak bağlandığında, enzimin aktivitesini engeller. İnhibitör-enzim kompleksinin ayrışması yavaştır, ancak olur. Tersine çevrilebilir inhibisyon geri alınabilirken, geri döndürülemez inhibisyon kalıcıdır. İki farklı engelleme türü hakkında bilgi edinmek için okumaya devam edin. Enziminizin hangisine ihtiyacı olduğunu merak ediyorsanız okumaya devam edin! Rekabetçi olmayan inhibisyon Tersinir inhibitörler, etki mekanizmalarına göre kategorize edilebilir. Rekabetçi olmayan inhibitörler, substrat bağımlılığına bağlı olarak enzimlerin Vmax’ını veya görünen Km’sini etkileyebilir. İkincisi, rekabetçi olmayan inhibitörlerin enzim-substrat kompleksinde bulunan substrat miktarını azaltmasından etkilenir. Sonuç olarak, Vmax azalır ve substrat için afinite artar. Bir tip tersinir inhibitör, rekabetçi değildir ve bunun…
-
Renal Hücreli Karsinom Yükselmiş Karaciğer Enzimleri
Yüksek Karaciğer Enzimlerinin Nedenleri Karaciğer enzimleri yüksek olan bir hastanın çeşitli durumları olabilir. Örneğin, Stauffer sendromu, Süksinat dehidrojenaz kompleksi veya serum protein elektroforezinde poliklonal gamopati, karaciğer enzimlerinin yükselmesine neden olabilir. Karaciğer enzimlerinin yükselmesi için hepatik olmayan nedenleriniz varsa, bu koşullar hakkında bilgi edinmek için okumaya devam edin. Belirtilerinizin belirli bir karaciğer bozukluğuyla ilişkili olup olmadığını belirlemenize yardımcı olabilir. Stauffer sendromu Renal hücreli karsinom (RCC) ve yüksek karaciğer enzimleri iki farklı durumdur. Hastaya renal hücreli karsinom ve yüksek karaciğer enzimleri teşhisi konduğunda, hekim semptomların NASH, alkolizm, metabolik sendrom ve altta yatan diğer tıbbi durumlar gibi diğer nedenlerini göz önünde bulundurmalıdır. Abdominal ultrason, diğer anormallikler tespit edilmeden önce tümörü tanımlayabildiğinden, RHK’nin erken…
-
Eşsiz bir mikro ortam
Enzimlerde Proton Tüneli Enzimlerdeki proton tünelleme mekanizması uzun süredir tartışılmaktadır. Hakim görüş, işlemin alt tabakanın termal aktivasyonunu gerektirdiği yönündedir. Aksine, VEGST teorisi böyle bir aktivasyon gerektirmez. Enzim moleküllerinin termal olarak uyarılmış solunmasıyla H-transferinin sıcaklığa bağımlılığını açıklar. Buna karşılık VEGST teorisi, enzimin substrat olmadan çalışabileceğini varsayar. Suyun enzim aktif bölgesinden dışlanması Su molekülleri her zaman bir enzimin aktif bölgesinden dışlanmaz. Karbonik anhidraz gibi birçok enzim aktif bölgelerinde su içerir. Bunun nedeni, hidrolizin reaksiyonu katalize etmek için suya ihtiyaç duymasıdır. Bu nedenle, suyu dışlayan enzimler genellikle hidrolizi önlemeye çalışırlar. Bunun neden bu kadar önemli olduğuna kısaca bir göz atalım: Enzimler suyu uzaklaştırmanın yanı sıra benzersiz bir mikro ortam da sergiler. Substrat molekülleri,…
-
Kirpi Enzimi | Tümör mikro ortamı
Kirpi Enziminin Mekanizmaları Tümörlerde kirpi enziminin inhibisyonu, tümör mikroçevresinde (TME) immün tolerans gelişimi ile ilişkilidir. Kanser hücrelerinde kirpi yollarıyla etkileşim, gelişmiş bağışıklık tepkilerini kolaylaştırabilir, böylece kontrol noktası inhibitörlerine karşı direnci önleyebilir ve mevcut toleransın üstesinden gelebilir. Ama kirpi enzimlerini nasıl hedef alırız? Bu kelime seçimi, kirpi aktivitesini düzenleyen mekanizmaların bir özetini sağlar. Yakın zamanda yapılan bir çalışmada araştırmacılar, yeni inhibitör LGK-974’ün, Wnt ligandlarını palmitoylate eden bir O-asiltransferaz olan Porcupine’i inhibe ettiğini buldu. İlaç, tümör malignitelerini, makrofajların polarizasyonunu ve Wnt/b-katenin sinyalini önemli ölçüde inhibe etti. Bununla birlikte, enzim oldukça seçici olduğundan, uygulaması araştırma amaçlarıyla sınırlıdır. Farelerde ve sıçanlarda yapılan çalışmalar, LGK-974’ün dokuda Wnt sinyalini inhibe ettiğini gösterdi, ancak bu, tümörlerde önceden…
-
Reaksiyon Enzim Kinetiği Sırası
Reaksiyon Enzim Kinetiğinin Sıfır Derecesi Bu makale Sıfır dereceli reaksiyon enzim kinetiği ve Michaelis-Menten modeli hakkında bilgi edinecek. Ek olarak, Hız belirleme adımı ve Spesifiklik sabiti hakkında bilgi edineceksiniz. Bu makale, reaksiyon enzim kinetiği hakkında en yaygın soruların bazılarına cevap vermelidir. Ardından, bu bilgiyi enzim tabanlı deneyler tasarlamak için kullanabileceksiniz. Herhangi bir sorunuz varsa, lütfen benimle iletişime geçmekten çekinmeyin. Sıfır dereceli reaksiyon enzim kinetiği Enzim kinetiğinde, Z oluşum hızı, B tüketim hızının iki katıdır. Normalde, A tüketim oranı bire birdir ve v alt simgesi atlanabilir. Ancak bu, enzim katalizli reaksiyonların çoğunda olmaz. Bu nedenle, bir reaksiyonun sıfır mertebesine sahip olması yaygın değildir. Bununla birlikte, oranın bu seviyeye ne zaman ulaştığını…
-
Enzimlerin Rekabetçi Olmayan İnhibisyonu Oluşur
Enzimlerin Rekabetçi Olmayan İnhibisyonu Nasıl Oluşur? Enzimlerin rekabetçi olmayan inhibisyonu birkaç farklı şekilde gerçekleşir. Geri dönüşümlü olabilir veya enzimin aktif bölgesine doğrudan bağlanmayı içerir. Rekabetçi inhibisyondan farklı olarak, bir inhibitörün bağlanması, enzimin bir substrata bağlanmasını engellemez, ancak ürünün oluşumunu belirli bir süre için bloke edebilir. Enzim inhibitörleri ayrıca enzimleri çeşitli şekillerde inhibe edebilir. Bu rapor, rekabetçi olmayan engellemenin meydana geldiği en yaygın yollardan bazılarını inceleyecektir. Tersinmez inhibisyon Tersinmez rekabetçi olmayan inhibitörler, enzimin aktif bölgesi olmayan bir kısmına bağlanarak bir enzimi bloke eder. Rekabetçi olmayan inhibisyonun, enzimi fiziksel olarak bloke ederek bloke ettiği düşünülür, ancak substratın bağlanmasını bloke etmez. Bunun yerine, katalitik bölgesinin şeklini değiştirerek bir enzimi inhibe eder. Bu inhibisyon…
-
Nagalaz Enzimi | a-N-acetylgalactosaminidase
Nagalaz Enzimi aN-asetilgalaktozaminidaz enzimi hakkında daha fazlasını öğrenmekle ilgileniyorsanız, doğru yere geldiniz. Bu makale size bu önemli enzim hakkında içeriden bilgi verecektir. Bu enzimin ayrıca diğer şeylerin yanı sıra HIV, grip ve kansere neden olduğu bilinmektedir. Otoimmün yanıtlarda da rol oynayabilir. Nagalazın otizmin bir nedeni olup olmadığı henüz belirlenmedi. aN-asetilgalaktozaminidaz AN-asetil-galaktosaminidaz önemli bir nagalaz enzimidir. Enzimin katalitik kalıntıları, 0.05 M sodyum fosfat tamponunda (pH 7.0) çözülür. Aktivitesini ölçmek için düşük moleküler ağırlıklı bir aN-asetil-galaktosaminidaz (a-PsGal) solüsyonu, sırasıyla 0.625 mM sulu solüsyon, 2.5 mM etanol ve 1M Na2C03 kullandık. Karışımı 30 dakika inkübe ettikten sonra, karışımdan 30 uL’lik bir kısım ayırdık.olan 120 uL 3.3 m aN-asetil-galaktosaminidaz ekleyerek reaksiyonu başlattık İnsan vücudunda…
-
Nagalase Enzim D Vitamini | Nagalazın klinik önemi
Nagalazın Kanser Tedavisindeki Rolü Nagalaz enzimi, D vitamini üzerindeki immün aktivatör bağlanma yerlerini ayırmaktan sorumludur. Bu proteinler, kanser dahil bulaşıcı hastalıklarda ve bağışıklık sistemi işlevinde makrofajları aktive eder. Kanser hücreleri ve virüs parçacıkları, GcMAF protein tesislerini hedef alan enzimi üretir. T lenfositlerini yok edebilir ve vücuttaki inflamatuar yanıtın azalmasından sorumludur. Bu enzim bir ilaç olarak kullanılabilirse, kanseri ve diğer enflamatuar durumları etkili bir şekilde tedavi edebilir. Nagalaz enzimi Araştırmacılar, kanser hastalarının ve çeşitli lösemi hastalarının kanında nagalaz enziminde artış bulmuşlardır. Bu aktivite kanser tipine, evresine, malignitesine ve invazivliğine göre değişir. Bu enzim normal vücut fonksiyonu için gereklidir ve bir kanser hastasının prognozu için önemlidir. Nagalazın kanser tedavisindeki rolü hakkında daha…
-
Mmp 13 Enzim ve Nöropati
MMP-13 Enzimi ve Nöropati Bu yazıda MMP-13 enziminin nöropatik ağrıdaki kısmını ve diyabetik nöropatiyi nasıl tedavi edebileceğini inceleyeceğiz. Annexin A2, TLR4 ve lizozimin rolüne de değineceğiz. Ayrıca MMP-13 enziminin bağışıklık sistemini nasıl düzenleyebileceğini de tartışacağız. Ama önce, enzimin TLR4 ve annexin A2 ile nasıl etkileşime girdiğine bir göz atalım. Artan lizozim seviyeleri Nörodejeneratif hastalıklarda sinir dokusunda artan lizozim seviyeleri ağrı ile ilişkilendirilmiştir. Ayrıca kronik ağrının gelişmesinde rol oynadığı gösterilmiştir. Lizozim, ağrının önemli bir aracısıdır ve kronik sinir ağrısı için potansiyel bir tedavidir. Nöronal TLR4 ve lizozimin sinir yaralanması sırasında birbirleriyle etkileşime girdiği gösterilmiştir. Bir çalışmada, nöropatik ağrılı hayvan modellerinde MMP-12 ekspresyonu artmıştır. Ek olarak, bu enzim, yaralı omurilik sinirlerinde IONP…
-
Enzim Kataliz PPT Kinetiği | Enzim katalizinin kinetiği
Enzim Katalizinin Kinetiğini Anlamak Enzimler, diyet proteinlerini peptitler adı verilen daha küçük bileşenlere ayırmak için hayati öneme sahiptir. Kimotripsin ve kimotripsin gibi enzimler bu süreçten sorumludur. Her ikisi de, omurga üzerindeki belirli konumlardaki peptit bağlarını parçalayabilir. Bu iki enzim, aromatik amino asitlere bitişik olarak parçalanır. Parçalanma mekanizmasını ve enzimlerin nasıl çalıştığını anlamak, bu enzimlerin insan sindirimi ve metabolizmasındaki rolünü anlamanıza yardımcı olacaktır. KM, enzim-substrat kompleksinin ayrışması için denge sabitidir Michaelis-Menten reaksiyonu, iki farklı molekül arasındaki ilişkiyi tanımlayan kimyasal bir reaksiyondur. Spesifik bir enzim, aynı substrat için başka bir enzimle rekabet edebilir. Michaelis sabitinin değerleri Km ve Vmax olarak bilinir. Bu iki parametre arasındaki ilişkiyi anlamak, substratın metabolik kaderini tahmin etmenizi…
-
izomeraz enzimi | Hidrofobik bağlanma yüzeyi
izomeraz enzimi İzomeraz enzimi, iyona duyarlı monofosfat grubunu iki değerlikli katyona tersine çevirerek hücre zarının redoks durumunu düzenlemekten sorumludur. Enzimin aktivitesini birkaç faktör kontrol eder. Bu faktörler, Hidrofobik bağlanma yüzeyini, Divalent Katyonlara Bağımlılığı ve Mutasyonları içerir. Bu enzimin farklı yönlerini keşfedelim. İzomeraz enziminin kararlılığı İzomeraz enziminin kararlılığı, reaksiyon mekanizmasına bağlıdır. Katalitik kalıntıları konumlandıran ve labil ara maddeleri koruyan bir aktif bölge döngü kapatmasıyla başlar. Enzimdeki tek Trp kalıntısı bu döngü içinde bulunur. Bu enzimin stabilitesini araştırmak için 13C etiketli numuneler kullanıldı. Trp’nin kapalı aktif formdaki kimyasal kayması, serbest enzim ile ilişkilidir, oysa aynı değişiklikler açık döngü konformasyonundadır. l-arabinoz izomeraz türevlerinin stabilitesi incelenmiştir. Çözünmeyen türevlerin, aynı pH’ta doğal enzimden daha düşük…
-
Su Bir Enzim midir?
Su Bir Enzim Katalizörü mü? Bir proteinin yapısı, enzimin nasıl çalıştığını anlamak için harika bir kaynaktır. Bu özellikler arasında Yapı, Dinamik, Katalitik verimlilik ve Seçicilik bulunur. Aşağıdaki bölümlerde bu özellikler daha ayrıntılı olarak açıklanmaktadır. Suyun enzimlere nasıl bağlandığını da tartışacağız. Bu yönleri anladıktan sonra, bu bilgiyi araştırmanıza uygulayabilirsiniz. Fizyolojileri ve işlevleri de dahil olmak üzere enzimlerin başka birçok yönü vardır. Su enzimlerinin moleküler dinamik (MD) simülasyonları, moleküllerinden ikisinin hidrojen bağları oluşturduğunu ve katalitik fonksiyonun oluşmasına izin verdiğini ortaya çıkardı. İki çözücü molekülü bir köprü görevi görürken, bir su kümesi enzimin aktif bölgesinin yapı taşını oluşturur. Anahtar hidrojen bağına sahip olmayan vahşi tip enzimin aksine, varyantların H-bağları oluşturma olasılığı aynıdır. Yabani…
-
Dehidrojenaz Bir Enzim midir? | Laktat dehidrogenaz
Dehidrogenaz Bir Enzim Nedir? İnsanlar enzimleri adlandırır ve çoğu zaman adlar onların işlevlerini tanımlar. Örneğin dehidrogenaz, adını geçirdiği ters reaksiyondan alır: hidrojeni bir şeyden uzaklaştırır ve başka bir şeye aktarır. Bu oldukça güzel bir özellik. FAD, Piruvat dehidrogenaz ve Laktat dehidrogenaz’ı tartışacağız. Laktat dehidrojenaz Laktat dehidrojenaz (LDH), piruvatı laktik aside dönüştüren bir enzimdir. Çoğu organizmada doğal olarak bulunur ve bir molekülden diğerine enerji transferinden sorumludur. Bir NADH kullanarak glikoliz yolunda çalışır. Bu da, glikoliz yolunun devam etmesine izin veren NAD+’yı serbest bırakır. Glikoliz yalnızca düşük oksijen altında meydana geldiğinden, laktat dönüşümü anaerobik koşullar altında gereklidir. Tetramerik protein laktat dehidrojenaz, alkol metabolizmasında yer alır ve tüm organ ve dokularda bulunur. Bu…
-
Enzimler Substratları Nasıl Kolokalize Eder?| kovalent kataliz
Enzimler Substratları Nasıl Kolokalize Eder? Kovalent ve asit-baz katalizi araçlarını, substrat kanal mekanizmasını ve enzimlerin Moleküler etkileşimlerini tartışacağız. Ayrıca kovalent bağların katalizdeki rolüne de bakacağız. Umarım, makalenin sonunda kovalent bağların enzim katalizindeki rolünü daha iyi anlayacaksınız. Kovalent kataliz Doğada, enzimler genellikle bağlantılı katalitik fonksiyonlara sahip kümelerde bulunur. Örneğin, tek bir polipeptit, bir metabolik yoldaki ardışık adımları katalize ederken, kovalent olmayan bir şekilde ilişkili büyük biyomolekül toplulukları, karmaşık hücresel süreçleri yürütür. Yol ara maddelerinin kesin olarak konumlandırılması, çözeltiye girdiklerinde ve alıcı bağlama sahasının yakınında kaldıklarında enzim kollokalizasyonunu sıklıkla kolaylaştırır. Bu yakınlık, etkileşenler arasında artan bağlanma verimliliğine yol açar. Enzim küreleri, birbirlerinin reaksiyonlarını engellemek için birden fazla aktif bölge ile tasarlanabilir. Bu…
-
Dört GAPC tipi GAPDH’den biri
Enzimlerin Fotosentezdeki Rolü Bitkiler güneş ışığını kullanılabilir enerjiye dönüştürmek için bir dizi enzim kullanır ve Rubisco en önemlilerinden biridir. Kloroplastlardaki proteinin yaklaşık yarısını oluşturur ve sekiz özdeş büyük alt birimden oluşur. Hem büyük hem de küçük alt birimler, kloroplast DNA’sından ve çekirdekten kopyalanan mRNA tarafından kodlanır. Birlikte, CO2’yi beş karbonlu bir moleküle dönüştüren bir reaksiyonu katalize ederler. RuBisCO’nun aktif bölgesi Ana fotosentez enzimi olan RuBisCO’nun aktif bölgesi oldukça çeşitlidir. Ekip, aktif bölgesindeki yük dağılımı ile CO2 fiksasyon oranı arasında bir bağlantı buldu. Araştırmacılar, RuBisCO karbondioksit sabitleme aktivitesini optimize ederek bitkilerdeki fotosentez oranlarını artırabilir, gıda arzını artırabilir ve emisyonları azaltabilir. Doçent Hiroki Ashida, Profesör Emere Akiho Yokota ve Doçent Eiichi Mizohata…
